Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms