Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms