Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms