Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra1P97785 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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