Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas2P97460 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas2P97460 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas2P97460 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas2P97460 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas2P97460 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms