Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas1P97459 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas1P97459 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas1P97459 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas1P97459 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas1P97459 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms