Protein–RNA interactions for Protein: P84075

Hpca, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpcaP84075 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HpcaP84075 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HpcaP84075 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HpcaP84075 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HpcaP84075 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HpcaP84075 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HpcaP84075 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HpcaP84075 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HpcaP84075 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms