Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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