Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Fgf11P70378 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fgf11P70378 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms