Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stra8P70278 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Stra8P70278 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stra8P70278 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stra8P70278 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stra8P70278 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stra8P70278 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms