Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chl1P70232 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chl1P70232 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chl1P70232 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chl1P70232 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chl1P70232 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chl1P70232 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chl1P70232 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chl1P70232 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Chl1P70232 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Chl1P70232 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chl1P70232 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chl1P70232 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chl1P70232 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chl1P70232 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms