Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms