Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf5P70191 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf5P70191 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf5P70191 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf5P70191 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf5P70191 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf5P70191 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf5P70191 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Traf5P70191 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Traf5P70191 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms