Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rps28P62858 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps28P62858 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps28P62858 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps28P62858 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps28P62858 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps28P62858 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps28P62858 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps28P62858 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms