Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms