Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PctpP53808 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PctpP53808 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PctpP53808 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PctpP53808 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PctpP53808 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PctpP53808 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PctpP53808 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PctpP53808 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PctpP53808 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PctpP53808 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PctpP53808 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PctpP53808 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PctpP53808 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PctpP53808 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PctpP53808 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PctpP53808 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PctpP53808 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PctpP53808 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PctpP53808 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PctpP53808 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PctpP53808 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PctpP53808 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PctpP53808 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PctpP53808 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PctpP53808 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PctpP53808 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PctpP53808 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PctpP53808 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PctpP53808 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PctpP53808 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PctpP53808 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PctpP53808 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PctpP53808 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PctpP53808 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PctpP53808 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PctpP53808 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PctpP53808 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PctpP53808 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PctpP53808 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PctpP53808 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PctpP53808 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PctpP53808 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PctpP53808 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PctpP53808 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PctpP53808 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PctpP53808 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PctpP53808 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PctpP53808 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PctpP53808 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PctpP53808 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PctpP53808 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PctpP53808 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PctpP53808 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PctpP53808 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PctpP53808 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PctpP53808 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PctpP53808 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PctpP53808 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PctpP53808 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PctpP53808 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PctpP53808 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PctpP53808 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PctpP53808 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PctpP53808 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PctpP53808 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PctpP53808 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PctpP53808 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PctpP53808 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PctpP53808 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PctpP53808 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PctpP53808 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PctpP53808 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PctpP53808 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PctpP53808 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PctpP53808 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PctpP53808 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PctpP53808 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PctpP53808 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PctpP53808 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PctpP53808 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PctpP53808 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PctpP53808 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PctpP53808 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PctpP53808 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PctpP53808 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PctpP53808 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PctpP53808 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PctpP53808 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PctpP53808 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PctpP53808 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PctpP53808 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PctpP53808 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PctpP53808 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PctpP53808 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PctpP53808 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PctpP53808 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PctpP53808 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PctpP53808 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PctpP53808 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms