Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa8P50706 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa8P50706 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa8P50706 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa8P50706 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa8P50706 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa8P50706 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa8P50706 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms