Protein–RNA interactions for Protein: P50538

Mxd1, Max dimerization protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mxd1P50538 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mxd1P50538 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mxd1P50538 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mxd1P50538 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mxd1P50538 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mxd1P50538 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mxd1P50538 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mxd1P50538 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mxd1P50538 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mxd1P50538 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mxd1P50538 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mxd1P50538 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mxd1P50538 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mxd1P50538 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mxd1P50538 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mxd1P50538 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mxd1P50538 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mxd1P50538 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mxd1P50538 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mxd1P50538 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mxd1P50538 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mxd1P50538 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mxd1P50538 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mxd1P50538 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mxd1P50538 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mxd1P50538 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mxd1P50538 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mxd1P50538 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mxd1P50538 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms