Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psen1P49769 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psen1P49769 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psen1P49769 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psen1P49769 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psen1P49769 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psen1P49769 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psen1P49769 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psen1P49769 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psen1P49769 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Psen1P49769 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Psen1P49769 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Psen1P49769 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psen1P49769 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psen1P49769 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psen1P49769 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms