Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox2P48432 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox2P48432 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox2P48432 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox2P48432 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox2P48432 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox2P48432 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox2P48432 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms