Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcd1P48410 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms