Protein–RNA interactions for Protein: P47911

Rpl6, 60S ribosomal protein L6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl6P47911 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl6P47911 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms