Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TfamP40630 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TfamP40630 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TfamP40630 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TfamP40630 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TfamP40630 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TfamP40630 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TfamP40630 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TfamP40630 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TfamP40630 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TfamP40630 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TfamP40630 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TfamP40630 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TfamP40630 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TfamP40630 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TfamP40630 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TfamP40630 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TfamP40630 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TfamP40630 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TfamP40630 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TfamP40630 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TfamP40630 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TfamP40630 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TfamP40630 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TfamP40630 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TfamP40630 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TfamP40630 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TfamP40630 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TfamP40630 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TfamP40630 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TfamP40630 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TfamP40630 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TfamP40630 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TfamP40630 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TfamP40630 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TfamP40630 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TfamP40630 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TfamP40630 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TfamP40630 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TfamP40630 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TfamP40630 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TfamP40630 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TfamP40630 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TfamP40630 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TfamP40630 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TfamP40630 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TfamP40630 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TfamP40630 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TfamP40630 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TfamP40630 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TfamP40630 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TfamP40630 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TfamP40630 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TfamP40630 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TfamP40630 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TfamP40630 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TfamP40630 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TfamP40630 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TfamP40630 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TfamP40630 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TfamP40630 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TfamP40630 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TfamP40630 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TfamP40630 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TfamP40630 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TfamP40630 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TfamP40630 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TfamP40630 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TfamP40630 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TfamP40630 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TfamP40630 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TfamP40630 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TfamP40630 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TfamP40630 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TfamP40630 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TfamP40630 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TfamP40630 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TfamP40630 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TfamP40630 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TfamP40630 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TfamP40630 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TfamP40630 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TfamP40630 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TfamP40630 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TfamP40630 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TfamP40630 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TfamP40630 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TfamP40630 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TfamP40630 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TfamP40630 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TfamP40630 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TfamP40630 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TfamP40630 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TfamP40630 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TfamP40630 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TfamP40630 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TfamP40630 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TfamP40630 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TfamP40630 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TfamP40630 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms