Protein–RNA interactions for Protein: P29037

Tbp, TATA-box-binding protein, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbpP29037 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TbpP29037 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TbpP29037 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TbpP29037 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TbpP29037 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TbpP29037 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TbpP29037 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TbpP29037 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TbpP29037 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TbpP29037 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TbpP29037 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TbpP29037 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TbpP29037 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TbpP29037 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TbpP29037 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TbpP29037 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TbpP29037 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TbpP29037 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TbpP29037 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TbpP29037 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TbpP29037 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TbpP29037 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TbpP29037 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TbpP29037 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TbpP29037 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TbpP29037 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TbpP29037 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TbpP29037 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TbpP29037 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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TbpP29037 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TbpP29037 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TbpP29037 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TbpP29037 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TbpP29037 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TbpP29037 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TbpP29037 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TbpP29037 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TbpP29037 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TbpP29037 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TbpP29037 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TbpP29037 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TbpP29037 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TbpP29037 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TbpP29037 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TbpP29037 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TbpP29037 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TbpP29037 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TbpP29037 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TbpP29037 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TbpP29037 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TbpP29037 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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TbpP29037 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TbpP29037 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TbpP29037 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TbpP29037 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TbpP29037 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TbpP29037 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TbpP29037 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TbpP29037 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TbpP29037 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TbpP29037 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TbpP29037 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TbpP29037 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TbpP29037 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TbpP29037 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TbpP29037 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TbpP29037 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TbpP29037 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TbpP29037 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TbpP29037 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TbpP29037 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TbpP29037 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TbpP29037 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TbpP29037 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TbpP29037 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TbpP29037 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TbpP29037 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TbpP29037 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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