Protein–RNA interactions for Protein: P28740

Kif2a, Kinesin-like protein KIF2A, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif2aP28740 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif2aP28740 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif2aP28740 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif2aP28740 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif2aP28740 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif2aP28740 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif2aP28740 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif2aP28740 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif2aP28740 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif2aP28740 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif2aP28740 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif2aP28740 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif2aP28740 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif2aP28740 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif2aP28740 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif2aP28740 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif2aP28740 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif2aP28740 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif2aP28740 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif2aP28740 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif2aP28740 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Kif2aP28740 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Kif2aP28740 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Kif2aP28740 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif2aP28740 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms