Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LoxP28301 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LoxP28301 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LoxP28301 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LoxP28301 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LoxP28301 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LoxP28301 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LoxP28301 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LoxP28301 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LoxP28301 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LoxP28301 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LoxP28301 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LoxP28301 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LoxP28301 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LoxP28301 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LoxP28301 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LoxP28301 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LoxP28301 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LoxP28301 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LoxP28301 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LoxP28301 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LoxP28301 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LoxP28301 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LoxP28301 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LoxP28301 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LoxP28301 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LoxP28301 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LoxP28301 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LoxP28301 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LoxP28301 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LoxP28301 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LoxP28301 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LoxP28301 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LoxP28301 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LoxP28301 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LoxP28301 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LoxP28301 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LoxP28301 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LoxP28301 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LoxP28301 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LoxP28301 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LoxP28301 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LoxP28301 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LoxP28301 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LoxP28301 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LoxP28301 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LoxP28301 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LoxP28301 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LoxP28301 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LoxP28301 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LoxP28301 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LoxP28301 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LoxP28301 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LoxP28301 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LoxP28301 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LoxP28301 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LoxP28301 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LoxP28301 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LoxP28301 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LoxP28301 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LoxP28301 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LoxP28301 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LoxP28301 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LoxP28301 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LoxP28301 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LoxP28301 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LoxP28301 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LoxP28301 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LoxP28301 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LoxP28301 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LoxP28301 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LoxP28301 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LoxP28301 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LoxP28301 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LoxP28301 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LoxP28301 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LoxP28301 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LoxP28301 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LoxP28301 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LoxP28301 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LoxP28301 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LoxP28301 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LoxP28301 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LoxP28301 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LoxP28301 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LoxP28301 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LoxP28301 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LoxP28301 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LoxP28301 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LoxP28301 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LoxP28301 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LoxP28301 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LoxP28301 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LoxP28301 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LoxP28301 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LoxP28301 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LoxP28301 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LoxP28301 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LoxP28301 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LoxP28301 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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