Protein–RNA interactions for Protein: P27699

Crem, cAMP-responsive element modulator, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CremP27699 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CremP27699 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CremP27699 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CremP27699 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CremP27699 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CremP27699 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CremP27699 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CremP27699 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CremP27699 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CremP27699 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CremP27699 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CremP27699 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CremP27699 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CremP27699 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CremP27699 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CremP27699 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CremP27699 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CremP27699 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CremP27699 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CremP27699 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CremP27699 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CremP27699 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CremP27699 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CremP27699 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CremP27699 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CremP27699 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CremP27699 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CremP27699 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CremP27699 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CremP27699 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CremP27699 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CremP27699 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CremP27699 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CremP27699 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CremP27699 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CremP27699 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CremP27699 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CremP27699 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CremP27699 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CremP27699 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CremP27699 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CremP27699 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CremP27699 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CremP27699 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CremP27699 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CremP27699 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CremP27699 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CremP27699 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CremP27699 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CremP27699 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CremP27699 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CremP27699 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CremP27699 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CremP27699 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CremP27699 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CremP27699 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CremP27699 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CremP27699 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CremP27699 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CremP27699 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CremP27699 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CremP27699 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CremP27699 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CremP27699 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CremP27699 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CremP27699 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CremP27699 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CremP27699 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CremP27699 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CremP27699 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CremP27699 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CremP27699 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CremP27699 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CremP27699 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CremP27699 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CremP27699 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CremP27699 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CremP27699 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CremP27699 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CremP27699 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CremP27699 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CremP27699 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CremP27699 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CremP27699 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CremP27699 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CremP27699 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CremP27699 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CremP27699 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CremP27699 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CremP27699 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CremP27699 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CremP27699 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CremP27699 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CremP27699 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CremP27699 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CremP27699 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CremP27699 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CremP27699 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CremP27699 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CremP27699 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.6 ms