Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl3P27659 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3P27659 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms