Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfraP26618 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 341.6 ms