Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja1P23242 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja1P23242 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja1P23242 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja1P23242 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja1P23242 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja1P23242 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gja1P23242 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja1P23242 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja1P23242 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja1P23242 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja1P23242 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms