Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ms4a1P19437 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms