Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms