Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms