Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NeflP08551 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NeflP08551 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NeflP08551 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NeflP08551 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NeflP08551 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NeflP08551 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NeflP08551 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NeflP08551 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NeflP08551 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NeflP08551 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NeflP08551 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NeflP08551 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NeflP08551 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NeflP08551 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NeflP08551 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NeflP08551 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NeflP08551 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NeflP08551 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NeflP08551 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NeflP08551 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NeflP08551 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NeflP08551 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NeflP08551 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NeflP08551 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NeflP08551 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NeflP08551 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NeflP08551 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NeflP08551 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NeflP08551 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NeflP08551 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NeflP08551 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NeflP08551 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NeflP08551 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NeflP08551 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NeflP08551 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NeflP08551 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NeflP08551 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NeflP08551 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NeflP08551 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NeflP08551 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NeflP08551 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NeflP08551 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NeflP08551 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NeflP08551 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NeflP08551 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NeflP08551 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NeflP08551 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NeflP08551 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NeflP08551 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NeflP08551 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NeflP08551 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NeflP08551 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NeflP08551 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NeflP08551 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NeflP08551 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NeflP08551 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NeflP08551 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NeflP08551 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NeflP08551 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NeflP08551 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NeflP08551 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NeflP08551 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NeflP08551 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NeflP08551 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NeflP08551 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NeflP08551 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NeflP08551 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NeflP08551 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NeflP08551 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NeflP08551 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NeflP08551 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NeflP08551 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NeflP08551 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NeflP08551 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NeflP08551 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NeflP08551 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NeflP08551 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NeflP08551 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NeflP08551 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NeflP08551 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NeflP08551 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NeflP08551 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NeflP08551 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NeflP08551 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NeflP08551 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NeflP08551 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NeflP08551 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NeflP08551 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NeflP08551 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NeflP08551 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NeflP08551 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NeflP08551 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NeflP08551 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NeflP08551 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NeflP08551 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NeflP08551 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NeflP08551 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NeflP08551 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NeflP08551 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms