Protein–RNA interactions for Protein: P06336

Ig epsilon chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06336 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06336 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06336 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06336 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06336 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P06336 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06336 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06336 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P06336 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06336 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06336 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06336 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06336 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06336 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06336 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06336 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06336 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06336 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06336 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06336 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06336 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06336 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06336 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06336 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06336 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06336 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06336 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06336 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06336 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06336 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06336 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06336 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06336 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06336 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06336 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06336 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06336 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06336 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06336 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06336 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P06336 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06336 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06336 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06336 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06336 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06336 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P06336 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06336 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P06336 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
P06336 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P06336 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P06336 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P06336 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06336 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06336 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06336 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06336 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06336 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06336 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06336 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06336 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06336 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06336 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06336 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06336 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06336 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06336 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06336 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06336 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06336 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06336 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06336 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06336 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06336 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06336 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06336 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06336 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06336 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P06336 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06336 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06336 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06336 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06336 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06336 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06336 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06336 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06336 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06336 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06336 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P06336 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06336 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06336 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06336 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06336 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P06336 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06336 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06336 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06336 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06336 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06336 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms