Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01648 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01648 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01648 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01648 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01648 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01648 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01648 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01648 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01648 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01648 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01648 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01648 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01648 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01648 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01648 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01648 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01648 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01648 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01648 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01648 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01648 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01648 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01648 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01648 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01648 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01648 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01648 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01648 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01648 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01648 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01648 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01648 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01648 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01648 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01648 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01648 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
P01648 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01648 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01648 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01648 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01648 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01648 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01648 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01648 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01648 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
P01648 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01648 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01648 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01648 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01648 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01648 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
P01648 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01648 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01648 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01648 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01648 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01648 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01648 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01648 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01648 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01648 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
P01648 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01648 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01648 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01648 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01648 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01648 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01648 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01648 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01648 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01648 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
P01648 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01648 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01648 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01648 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01648 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01648 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01648 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
P01648 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01648 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01648 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01648 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01648 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01648 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01648 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01648 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01648 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01648 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01648 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01648 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01648 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01648 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01648 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01648 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01648 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01648 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01648 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01648 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01648 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 370.5 ms