Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casp8O89110 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casp8O89110 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casp8O89110 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casp8O89110 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Casp8O89110 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casp8O89110 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casp8O89110 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casp8O89110 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Casp8O89110 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Casp8O89110 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp8O89110 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp8O89110 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp8O89110 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp8O89110 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp8O89110 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms