Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RngttO55236 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RngttO55236 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RngttO55236 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RngttO55236 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RngttO55236 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RngttO55236 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RngttO55236 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RngttO55236 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RngttO55236 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RngttO55236 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RngttO55236 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RngttO55236 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RngttO55236 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RngttO55236 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RngttO55236 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RngttO55236 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RngttO55236 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RngttO55236 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RngttO55236 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RngttO55236 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RngttO55236 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RngttO55236 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RngttO55236 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RngttO55236 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RngttO55236 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RngttO55236 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RngttO55236 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RngttO55236 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RngttO55236 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RngttO55236 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RngttO55236 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RngttO55236 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RngttO55236 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RngttO55236 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RngttO55236 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RngttO55236 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RngttO55236 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RngttO55236 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RngttO55236 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RngttO55236 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RngttO55236 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RngttO55236 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RngttO55236 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RngttO55236 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RngttO55236 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RngttO55236 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RngttO55236 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RngttO55236 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RngttO55236 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RngttO55236 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RngttO55236 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RngttO55236 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RngttO55236 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RngttO55236 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RngttO55236 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RngttO55236 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RngttO55236 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RngttO55236 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RngttO55236 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RngttO55236 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RngttO55236 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RngttO55236 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RngttO55236 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RngttO55236 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RngttO55236 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RngttO55236 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RngttO55236 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RngttO55236 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RngttO55236 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RngttO55236 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RngttO55236 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RngttO55236 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RngttO55236 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RngttO55236 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RngttO55236 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RngttO55236 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RngttO55236 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RngttO55236 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RngttO55236 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RngttO55236 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RngttO55236 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RngttO55236 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RngttO55236 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RngttO55236 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RngttO55236 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RngttO55236 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RngttO55236 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RngttO55236 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RngttO55236 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RngttO55236 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RngttO55236 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RngttO55236 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RngttO55236 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RngttO55236 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RngttO55236 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RngttO55236 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RngttO55236 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RngttO55236 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RngttO55236 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms