Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Psmb5O55234 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb5O55234 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms