Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rab33bO35963 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rab33bO35963 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rab33bO35963 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rab33bO35963 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rab33bO35963 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rab33bO35963 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rab33bO35963 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rab33bO35963 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rab33bO35963 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rab33bO35963 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rab33bO35963 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rab33bO35963 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab33bO35963 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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