Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnd2O35927 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms