Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms