Protein–RNA interactions for Protein: O35701

Matn3, Matrilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn3O35701 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matn3O35701 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Matn3O35701 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Matn3O35701 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Matn3O35701 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Matn3O35701 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms