Protein–RNA interactions for Protein: O35691

Pnn, Pinin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnnO35691 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PnnO35691 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PnnO35691 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PnnO35691 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PnnO35691 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PnnO35691 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PnnO35691 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PnnO35691 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PnnO35691 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PnnO35691 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PnnO35691 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PnnO35691 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PnnO35691 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PnnO35691 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PnnO35691 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PnnO35691 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PnnO35691 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PnnO35691 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PnnO35691 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PnnO35691 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PnnO35691 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PnnO35691 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PnnO35691 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PnnO35691 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PnnO35691 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PnnO35691 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PnnO35691 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PnnO35691 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PnnO35691 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PnnO35691 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PnnO35691 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PnnO35691 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PnnO35691 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PnnO35691 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PnnO35691 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PnnO35691 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PnnO35691 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PnnO35691 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PnnO35691 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PnnO35691 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PnnO35691 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PnnO35691 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PnnO35691 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PnnO35691 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PnnO35691 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PnnO35691 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PnnO35691 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PnnO35691 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PnnO35691 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PnnO35691 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PnnO35691 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PnnO35691 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PnnO35691 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PnnO35691 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PnnO35691 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PnnO35691 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PnnO35691 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PnnO35691 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PnnO35691 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PnnO35691 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PnnO35691 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PnnO35691 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PnnO35691 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PnnO35691 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PnnO35691 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PnnO35691 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PnnO35691 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PnnO35691 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PnnO35691 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PnnO35691 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PnnO35691 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PnnO35691 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PnnO35691 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PnnO35691 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PnnO35691 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PnnO35691 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PnnO35691 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PnnO35691 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PnnO35691 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PnnO35691 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PnnO35691 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PnnO35691 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PnnO35691 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PnnO35691 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PnnO35691 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PnnO35691 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PnnO35691 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PnnO35691 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PnnO35691 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PnnO35691 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PnnO35691 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PnnO35691 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PnnO35691 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PnnO35691 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PnnO35691 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PnnO35691 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PnnO35691 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PnnO35691 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PnnO35691 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PnnO35691 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms