Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1dO35473 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1dO35473 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1dO35473 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1dO35473 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1dO35473 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
C1dO35473 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1dO35473 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1dO35473 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1dO35473 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1dO35473 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1dO35473 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1dO35473 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C1dO35473 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1dO35473 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1dO35473 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1dO35473 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1dO35473 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1dO35473 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1dO35473 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1dO35473 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1dO35473 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1dO35473 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1dO35473 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C1dO35473 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1dO35473 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1dO35473 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1dO35473 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1dO35473 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1dO35473 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1dO35473 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1dO35473 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1dO35473 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1dO35473 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1dO35473 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1dO35473 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C1dO35473 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1dO35473 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1dO35473 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1dO35473 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1dO35473 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1dO35473 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1dO35473 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1dO35473 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1dO35473 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1dO35473 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1dO35473 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1dO35473 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1dO35473 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1dO35473 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1dO35473 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1dO35473 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1dO35473 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1dO35473 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1dO35473 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C1dO35473 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C1dO35473 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1dO35473 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1dO35473 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1dO35473 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1dO35473 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1dO35473 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1dO35473 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1dO35473 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1dO35473 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1dO35473 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1dO35473 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1dO35473 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1dO35473 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1dO35473 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1dO35473 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1dO35473 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1dO35473 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1dO35473 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1dO35473 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1dO35473 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1dO35473 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1dO35473 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1dO35473 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1dO35473 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1dO35473 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1dO35473 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1dO35473 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1dO35473 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1dO35473 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1dO35473 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1dO35473 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C1dO35473 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1dO35473 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C1dO35473 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1dO35473 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1dO35473 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1dO35473 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1dO35473 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1dO35473 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1dO35473 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1dO35473 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1dO35473 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1dO35473 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1dO35473 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms