Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Nedd9O35177 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Nedd9O35177 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Nedd9O35177 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Nedd9O35177 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Nedd9O35177 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Nedd9O35177 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Nedd9O35177 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Nedd9O35177 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Nedd9O35177 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Nedd9O35177 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Nedd9O35177 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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