Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn4O35054 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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