Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckarO08786 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckarO08786 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckarO08786 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckarO08786 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckarO08786 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckarO08786 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CckarO08786 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CckarO08786 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckarO08786 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckarO08786 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CckarO08786 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckarO08786 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckarO08786 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckarO08786 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckarO08786 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckarO08786 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckarO08786 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckarO08786 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckarO08786 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckarO08786 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckarO08786 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckarO08786 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckarO08786 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckarO08786 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckarO08786 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckarO08786 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckarO08786 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckarO08786 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckarO08786 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckarO08786 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckarO08786 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckarO08786 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckarO08786 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckarO08786 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CckarO08786 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckarO08786 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CckarO08786 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckarO08786 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckarO08786 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckarO08786 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckarO08786 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CckarO08786 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckarO08786 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckarO08786 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckarO08786 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckarO08786 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckarO08786 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckarO08786 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckarO08786 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckarO08786 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckarO08786 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckarO08786 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckarO08786 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CckarO08786 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckarO08786 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckarO08786 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckarO08786 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckarO08786 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckarO08786 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckarO08786 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckarO08786 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CckarO08786 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CckarO08786 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CckarO08786 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CckarO08786 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CckarO08786 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CckarO08786 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CckarO08786 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CckarO08786 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CckarO08786 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CckarO08786 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CckarO08786 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CckarO08786 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CckarO08786 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CckarO08786 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CckarO08786 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CckarO08786 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CckarO08786 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CckarO08786 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CckarO08786 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CckarO08786 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CckarO08786 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CckarO08786 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CckarO08786 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CckarO08786 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CckarO08786 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CckarO08786 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CckarO08786 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CckarO08786 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CckarO08786 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CckarO08786 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CckarO08786 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CckarO08786 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CckarO08786 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CckarO08786 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CckarO08786 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CckarO08786 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CckarO08786 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CckarO08786 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms