Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efna5O08543 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efna5O08543 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efna5O08543 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efna5O08543 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efna5O08543 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efna5O08543 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efna5O08543 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efna5O08543 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efna5O08543 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efna5O08543 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efna5O08543 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efna5O08543 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms