Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp955bL7N232 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp955bL7N232 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp955bL7N232 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp955bL7N232 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp955bL7N232 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp955bL7N232 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp955bL7N232 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp955bL7N232 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp955bL7N232 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms